又一个大牛去了

Lisp语言的发明者，人工智能的奠基者之一，John McCarthy 23日病逝。。。

虽然不熟，但鉴于是 emacs 用户，感激并纪念一下。。

双管。。。。

想从理论上证明 Ciccoti 的理论适用于巨正则系综。。。。我觉得我能给一个很简洁的证明。。。但是对于 adress 来说难处在于没有 Hamiltonian，因此小老板很纠结的在从他认为对的方向证。。。我很难理解。。。。觉。觉得他的方法太罗嗦了，很多事情说不清楚。。。。而且我讲的他听不太懂的。。。。

模拟上觉得加C质墙壁型热浴基本是扯。。。为什么做不成我现在心理没数。。。决定试试和空间相关的 Langevian 热浴

缅怀 Dennis Ritchie

2011年10月12日，Dennis Ritchie 去世了（BBC 新闻），比起铺天盖地的 Jobs 去世的消息，他的去世显得少有人知。但是对于我，Jobs 是谁我根本不关心，因为我根本不用苹果的产品。但是我每天都在使用 Unix 系统的直系子孙 Linux，每天都在用由 C 语言编写的软件（包括 Linux），自己写程序也会使用 C/C++。没有 Dennis Ritchie 这个世界的计算机会是什么样子真的无法想象。

缅怀 Dennis Ritchie

今天见了大老板

灰常高兴，灰常高兴

perturbed MSM，据说大老板在做数学理论的文章，周末就可以弄好，说下周四能给我讲讲，但是谁知道呢。。。。下周四我做报告！！

现在的目标是从已有的MSM算出 perturbed 的 MSM，据说大老板的数学理论能够计算 perturbed projected transition operator。如果要用MD模拟进行计算，那么 Govanni 的模拟理论就需要不平凡的扩展。具体要作成什么样子最好先听听大老板的扰动理论怎么做的。

另外，Govanni 的理论到底能不能被直接推广到 Grand-canonical simulation？虽然直观看是很直接的，但是我觉得并不保险。深入的想想发现 Govanni 非平衡态模拟理论只有对 micro-canonical 系综才是显然正确的，那么对 canonical 系综呢？对 grand-canonical 呢？我觉得推广并不直接。。。突然发现一个很弱智的问题我都不明白了：什么是 canonical 系综？？精神崩溃中。。。。

为什么要做科研（想到啥写啥，不断更新）

好的地方：

1，学习很有成就感。。

2，这些数学理论真的很美。

3，鄙视 windows 用户获得愚蠢的快感。。。

4，喜欢把一个问题想清楚的感觉

5，因为提了很好的问题可以臭美半天。。。真的是半天。。。

不好的地方：

1，程序调不出暴躁易怒。

2，事情干不完压力大。。。情绪压抑。。。

3，想到很多但是都没时间做，特别有挫折感。。。

4，因为自己太笨深感挫折。。。

5，有时为没钱苦闷。。。

斯图加特

周三到周日访问斯图加特

见了 Flo 和 Christian 非常开心能看见误差估计在 Gromacs 中实现。。真正看过 Gromacs 代码才知道他们有多不容易。。。

下面看看能不能把 correlation error 算好，尤其是对水做误差估计。

没有大计算机，科研没进展。。。

明天终于能见老板啦，^_^ 很为不能常见老板苦恼。。唉。。。

今天总算把短程的文章的初稿写好了。。。。从8月底写到现在。。。速度啊速度。。。

十月十日

十十

日月

节日快乐。。。

gromacs+adress

上周。。好吧。。

gromacs + adress, 对代码有了初步的了解。。还真不是一般的混乱啊。。。。不过改改还是挺好玩的。和 seb 学到了很多。

setup 全原子heat convection flow 的模拟，还没有统计。。。

没什么思考。。。短程的文章继续写，没效率啊没效率。。。

想见大老板见不到。。。有些想法但是没法讨论。。

为什么时间过的这么快。。。感觉什么还都没做！！！疯了。。。

觉得 adress 中对能量插值再求导得到对空间依赖的项就是 thermodynamic force, 和小老板讨论瞬间就被鄙视了。。。。唉。。。。