非平衡态体系——暴力计算与 MSM

在做非平衡态体系的文献准备。发现之前对 MSM 的理解非常不深刻。或者说想不起来自己之前是怎么理解的了。。。。Leiden 会议对我提供了新的观点。现在再来看 MSM 就有了新思路。

Marco 写了非平衡态体系 commitor 如何计算。似乎是非常理论的工作，不过其中的定义对我很有启发。

终于有点理解大老板的终极目标了：对非平衡态体系建立 MSM，用约化的动力学代替原体系的动力学。觉得这件事情是可以做的了。 至少暴力计算是有思路的，至于怎么做 MSM 约化需要对MSM做更好的理解，然后推公式！

文章投了

自适应理论分析文章投 PRX 了。。。。好运。。。。

化学势依然无进展。。和CH聊过后更迷惑了。。。

化学势无进展，开始修炼微分流形。。。。

化学势还是毫无进展。考虑了很多可能，但是还是找不到原因。 大概还有几个方面不是很清楚，可以考虑：

1，对于有约束体系，配分函数到底怎么写？
2，TPI 貌似还不能很好的收敛。测试这样的体系：比较两个全原子体系的压强差和自由能差。
3，Gaia 坏了。。。没效率！！！！

非平衡态由于 gaia 的问题进展缓慢。。。